В Академии, сверкающем городе света и разума на юге Японии, сосредоточены надежды человечества. Но даже здесь, среди высоких технологий и научных достижений, не ведают о надвигающихся катастрофах. Ученые, не обремененные моралью, осознают, что только сила их воспитанников, эсперов, способна защитить от врагов и открыть путь в неизведанные области, ранее считавшиеся запретными для людей. В Академии царит видимый покой, однако в воздухе витает напряжение, а ночами гремят не только грозы.
Микото Мисака, одна из сильнейших эсперов, сталкивается с призраками своего прошлого. Разобраться с ними не получится лишь с помощью молний — здесь требуется ум и смекалка. Ступив на грань добра и зла, она осознает, что в городе идет тайная война, в которой участвуют десятки сторон, каждая из которых имеет свою правду. В этом хаосе ей на помощь приходит рейлган и остроумие, позволяющие находить общий язык с самыми разными персонажами — от белобрысых психопатов до хитроумных блондинок и даже ходячих лазерных пушек.
Новые родственницы и неожиданные союзники, такие как маньячка Куроко, могут оказаться полезными в этой борьбе. Микото предстоит не только сразиться с врагами, но и разобраться в сложных отношениях с окружающими. В Академии, где наука и магия переплетаются, ей предстоит выяснить, что истинная сила заключается не только в умении сражаться, но и в способности понять и принять свою судьбу.