Макото Ито — обычный японский школьник, который смирился с ролью простого наблюдателя в жизни. Он не выделяется среди сверстников и не обладает выдающимися качествами, что заставляет его чувствовать себя незаметным. Каждый день он ездит в школу на поезде, где его взгляд часто останавливается на симпатичной Котонохе, с которой он пересекается в утренние часы. Однако, несмотря на свои чувства, Макото не решается подойти к ней и завести разговор.
Всё меняется, когда на горизонте появляется Сэкай Сайондзи — энергичная и решительная одноклассница, которая замечает внутренние переживания Макото. Она, движимая добротой и желанием помочь, решает взять ситуацию в свои руки и становится его союзником в любовных делах. Сэкай, обладая харизмой и смелостью, начинает действовать, чтобы помочь Макото сблизиться с Котонохой.
Однако, как это часто бывает в жизни, простые планы могут привести к неожиданным последствиям. Взаимоотношения между героями начинают запутываться, и вскоре Макото оказывается в центре любовного треугольника, где чувства, ревность и недопонимание переплетаются. С каждой новой серией Макото, Сэкай и Котоноха сталкиваются с непростыми выборами, которые будут определять их судьбы и отношения.
«Школьные дни» — это не просто романтическая история о подростках, но и глубокая драма, исследующая тонкие грани человеческих эмоций и последствий принятых решений. Сюжет заставляет задуматься о том, как легко можно потерять контроль над своей жизнью и как важно быть честным с самим собой и окружающими.