В продолжении аниме-сериала «Парень из эпохи Бакумацу» главные герои, Синсаку Такасуги и его преданный друг Когоро Кацура, наконец-то разобрались с запутанными временными параллелями и готовы вернуться в свою эпоху. Однако их планы рушатся, когда оказывается, что, казалось бы, уничтоженный «хронометр» обрел собственную волю и начинает восстанавливаться. На первый взгляд, это может показаться положительным событием — ведь без него они не смогут вернуться домой. Но дело обстоит гораздо серьезнее: восстановление «хронометра» происходит через опасные временные разломы, которые влекут за собой хаос, внося элементы из других миров и нанося непоправимый урон их реальности.
Ситуация усугубляется появлением таинственного «законного преемника» Мугэнсая, который имеет свои собственные планы и амбиции. Этот новый противник не только угрожает миру, в котором оказались Синсаку и Когоро, но и ставит под сомнение саму природу времени и пространства. Друзья должны объединить свои силы, чтобы не только остановить разрушительные последствия действий «хронометра», но и выяснить, какие тайны скрывает их новый враг.
В этом новом приключении им предстоит столкнуться с загадками, которые могут изменить ход истории, и испытаниями, проверяющими их дружбу и решимость. Синсаку и Когоро должны найти способ восстановить баланс, прежде чем разломы поглотят их мир, и время окончательно выйдет из-под контроля. Сумеют ли они справиться с угрозами как из прошлого, так и из будущего? Ответ на этот вопрос станет ключом к их судьбе и судьбе всей Японии.