В живописных джунглях, где обитает обычный мальчик Хале, его беззаботная жизнь внезапно меняется, когда мама отправляет его за бананами. Увлечённый играми на приставке, он неохотно покидает мир виртуальных приключений. На обратном пути его пугает нечто большое и тёмное, заставляя его в панике мчаться домой. Там он обнаруживает, что их семья принимает необычного гостя — милую девочку по имени Гуу.
Утром Хале просыпается и к своему ужасу видит, что лицо Гуу изменилось — теперь оно выглядит зловеще, но окружающие не замечают этого. Гуу ведёт себя спокойно, и Хале решает показать ей окрестности. Однако их прогулка принимает неожиданный поворот, когда Гуу неожиданно проглатывает птичку, а затем и самого Хале.
Попадая в загадочный мир, находящийся внутри Гуу, Хале встречает Сэйити и Томоё, которые давно смирились с жизнью в животе своей странной подруги. Они делятся с ним историями о своих приключениях и странных правилах этого внутреннего мира. Хале начинает осознавать, что происходящее не может быть простым сном, как он надеялся.
Когда Гуу отправляется с Хале в школу, её голод становится ещё более опасным — она проглатывает его одноклассников, оставляя Хале в ужасе от того, что его жизнь навсегда изменилась. Теперь он должен найти способ вернуть всё на свои места, прежде чем Гуу пожрёт всех вокруг. Аниме "В джунглях всё было хорошо, пока не пришла Гуу" погружает зрителей в захватывающее и странное путешествие, полное приключений, юмора и неожиданных поворотов.