За несколько лет до начала событий аниме "Медвежья буря, лилий ураган" в космосе появился загадочный астероид Кумария, осколки которого, пронзив атмосферу, обрушились на Землю в виде метеоритного дождя. Эти космические явления стали катализатором неожиданной эволюции: на планете появились человеко-медведи — существа, обладающие как человеческими, так и медвежьими чертами. Конфликт между ними и обычными людьми вспыхнул с неимоверной силой, обе стороны понесли тяжёлые потери, стремясь выяснить, кто же выйдет победителем из этой жестокой борьбы.
С течением времени, чтобы прекратить кровопролитие, была возведена гигантская "Стена вымирания", ставшая символом разделения двух рас. Этот шаг положил начало новому этапу — эпохе мирного сосуществования, в которой каждое существо пытается найти своё место в изменившемся мире.
Главная героиня, Курэха Цубаки, — обычная школьница, чья жизнь кардинально меняется в первый день учёбы. Она сталкивается с таинственной девушкой по имени Гинко Юрисиро, которая, как утверждают слухи, является человеко-медведем. Их встреча становится началом удивительного пути, полного открытий и испытаний. Курэха оказывается втянута в мир, где границы между расами размыты, и ей предстоит разобраться в своих чувствах и предрассудках.
Сюжет аниме исследует темы дружбы, предательства и поиска идентичности в условиях конфликтов, задавая вопрос о том, что на самом деле делает нас людьми. В "Медвежьей буре, лилий ураган" зрители становятся свидетелями не только борьбы за выживание, но и поисков взаимопонимания в мире, раздираемом войной.