С древних времён клан Сумэраги славится своими оммёдзи, магами, защищающими Токио от злых духов и стремящимися умиротворить их. В центре событий оказывается шестнадцатилетний Субару Сумэраги, который унаследовал лидерство от своих выдающихся предков. Несмотря на свои магические способности, он остаётся скромным и интеллигентным юношей, чья женственность порой ставит его в один ряд с его очаровательной сестрой-близнецом Хокуто. Вместе с ними всегда находится Сэйсиро Сакурадзука, талантливый ветеринар и также оммёдзи, чья магия сопоставима с силой Субару. Между Хокуто и Сэйсиро прослеживается некая симпатия, однако сердце последнего принадлежит её брату.
В первом эпизоде Субару получает задание снять проклятие, нависшее над местом, где планируется строительство величественных небоскрёбов в Токио, после того как ряд высокопрофильных руководителей погиб при загадочных обстоятельствах. Во втором эпизоде он помогает полиции поймать серийного убийцу, который терроризирует город. В обоих случаях Субару, опираясь на поддержку Хокуто и Сэйсиро, сталкивается с тёмными силами, скрывающимися под блестящей поверхностью мегаполиса. Ночная панорама Токио, полная загадок и опасностей, становится фоном для их борьбы с демоническими сущностями, угрожающими не только их жизни, но и всему городу. "Токио – Вавилон" представляет собой захватывающее сочетание магии, драмы и мистики, погружая зрителей в мир, где добро и зло находятся в постоянной борьбе.
