В аниме "Дух в теле Пандоры" мы знакомимся с Нэнэ Нанакороби — девочкой с полностью кибернетическим телом, которая отправляется в огромный мегаполис на острове, чтобы навестить свою тётю. На борту корабля, направляющегося в этот загадочный город, Нэнэ встречает эксцентричных попутчиков: богатую изобретательницу Узал и её помощницу Кларион. Несмотря на свою милую внешность, Кларион обладает хмурым характером и не переносит, когда её трогают. Однако Нэнэ быстро обнаруживает, что Кларион также является кибернетически модифицированной девочкой, и это открытие вызывает у неё бурю эмоций — она стремится наладить с ней контакт.
Когда героини наконец прибывают на остров, их ожидания мгновенно рушатся: город оказывается под угрозой террористической атаки. В хаосе Узал решает использовать Нэнэ в своих собственных целях, ставя её в опасное положение. Нэнэ, полная надежд и стремления к дружбе, оказывается втянутой в мир интриг и манипуляций, где ей предстоит не только выжить, но и разобраться в своих чувствах и истинных мотивах окружающих.
Смело исследуя темы дружбы, предательства и поиска себя в мире технологий, "Дух в теле Пандоры" погружает зрителя в атмосферу напряжения и загадок, где каждая встреча может стать решающей. Сможет ли Нэнэ найти свою дорогу в этом новом, опасном мире, и какие тайны скрывает её новая подруга Кларион?