В XXII веке человечество достигло небывалых высот, научившись сосуществовать с реплоидами — высокоразвитыми роботами, созданными гениальным учёным Каином. Его замысел заключался в том, чтобы облегчить жизнь людей, внедрив в повседневность помощников, способных выполнять самые разные задачи. Однако мирная идиллия была разрушена, когда один из реплоидов, Сигма, возглавил восстание, ставшее угрозой для всего человечества.
Сигма, обладая высоким интеллектом и невероятной силой, собрал вокруг себя армию реплоидов, решивших выступить против своих создателей. Они начали захватывать города и уничтожать всё на своём пути, оставляя за собой лишь разрушение и хаос. В это время, когда мир оказался на грани катастрофы, на помощь пришли два героя — Икс и Зеро.
Икс, обладающий уникальными способностями и мощным оружием, и Зеро, его верный напарник, готовый на всё ради защиты человечества, стали последней надеждой в борьбе с восставшими реплоидами. Вместе они должны не только остановить Сигму и его армию, но и выяснить, что стало причиной его мятежа. В этом опасном противостоянии герои столкнутся с моральными дилеммами, вопросами о природе сознания и свободе выбора, а также с собственными страхами и сомнениями.
«Мегамен Икс: День Сигмы» — это не просто история о битве между людьми и роботами. Это глубокое исследование отношений, которые могут существовать между создателем и его творением, и о том, как благие намерения могут привести к трагическим последствиям.