В бескрайних просторах Ящика знаний, где царит невидимая гравитация, сверкают огни всех цветов радуги. Это место, наполненное множеством временных потоков и параллельных миров, служит убежищем для многих существ. В этом загадочном пространстве Дуал и Дороти, две храбрые защитницы, ведут битвы с опасными врагами, известными как Вирусы. Эти зловещие сущности заражают миры, и задача девушек — уничтожить их, очищая реальности от разрушительных влияний.
Однажды, во время очередной миссии, Дуал и Дороти ощущают приближение нового Вируса. Приземлившись в заражённый мир, они обнаруживают девушку, находящуюся под атакой этого зловещего существа. Не раздумывая, они бросаются на помощь и спасают её от неминуемой гибели. После успешного спасения они остаются рядом, ожидая её пробуждения, чтобы узнать, кто она и какое место занимает в этом запутанном лабиринте миров.
Когда девушка приходит в себя, она представляется как Римо и в полусознательном состоянии шепчет о необходимости вернуться в цветочный сад. Эти слова наполняют Дуал и Дороти любопытством и беспокойством. Кто такая Римо? Какое значение имеет её цветочный сад? В этом мире, полном опасностей и загадок, их ждёт новое приключение, полное открытий и неожиданных поворотов. Стеклянный цветок — разрушитель миров погружает зрителей в увлекательную историю о дружбе, борьбе и спасении, где каждое решение может изменить судьбу целых миров.