В 2015 году, в разрушенном мире Токио-3, последствия Второго удара все еще ощущаются. Прошло 15 лет с тех пор, как Антарктида исчезла, и планета погрузилась в хаос, унесший жизни большинства людей. Теперь Землю атакуют таинственные существа, известные как Ангелы. Эти создания представляют собой угрозу, с которой человечество может справиться лишь с помощью гигантских биомеханических роботов — Евангелионов, созданных организацией NERV.
14-летний Синдзи Икари, юноша, страдающий от недостатка любви и понимания, оказывается втянутым в этот конфликт, когда его призывают к отцу — главе NERV. Он полон противоречивых чувств, особенно ненависти к родителю, который долгое время игнорировал его. Однако, когда Токио-3 подвергается нападению Ангела, Синдзи оказывается перед выбором: сбежать или стать пилотом Евангелиона.
Вместе с капитаном Мисато Кацураги он пробирается в подземный штаб NERV, где его ждёт не только встреча с отцом, но и необходимость сесть за штурвал гигантского робота. Синдзи сталкивается с внутренними демонами и страхами, осознавая, что его судьба и судьба человечества теперь в его руках. В этом мире, полном страха и одиночества, ему предстоит не только сражаться с Ангелами, но и найти свой путь к самоосознанию и принятию. «Евангелион» становится не только битвой с врагами, но и глубоким исследованием человеческой души, отношений и стремления к пониманию.