Кирисима Харуто ведет размеренную жизнь в тихой деревушке Хиросима, наслаждаясь простыми радостями и спокойствием. Однако судьба решает внести изменения в его привычный уклад, когда к нему в дом переезжает загадочная девушка из Токио по имени Юдзуки Эба. Сначала Харуто категорически против совместного проживания, но вскоре ему приходится смириться с новым соседом. Эба, обладая не только привлекательной внешностью, но и ярким характером, становится источником постоянных хлопот для Харуто.
Тем не менее, его сердце принадлежит другой — однокласснице Канзаки Нанами, и из-за этого чувства Эба становится не только соседкой, но и причиной внутреннего конфликта Харуто. Постепенно их взаимодействие становится всё более запутанным: Эба, невольно вмешиваясь в жизнь Харуто, заставляет его переосмыслить свои чувства и приоритеты.
Каждый день приносит новые испытания, когда Эба проявляет свою игривую натуру, создавая недоразумения и комические ситуации. Харуто оказывается в центре не только романтических, но и дружеских конфликтов, которые ставят под сомнение его отношения с Нанами. Мальчику предстоит разобраться в своих чувствах, научиться принимать людей такими, какие они есть, и, возможно, открыть для себя новые горизонты в любви и дружбе.
Аниме "Город, в котором ты живёшь" погружает зрителя в мир юношеских переживаний, где каждое мгновение может изменить всё, а простые радости жизни становятся основой для больших свершений.