Мюнхен, 1923 год. Два года минуло с того момента, как Эдвард Элрик был выброшен из своего родного мира, оставив позади друзей, родной край и младшего брата Альфонса. Лишённый способности к алхимии, он погрузился в изучение ракетной техники вместе с Альфонсом Хайдерихом — молодым человеком, удивительно похожим на его брата. Эдвард надеется, что их совместные усилия помогут найти способ вернуться домой. Однако все попытки до сих пор были безуспешными.
Всё меняется, когда Эдвард узнаёт, что Общество Туле — оккультная организация, тесно связанная с нацистской партией, — обнаружила ключ к местонахождению загадочной страны Шамбалы. Эта новость пробуждает в нём надежду на возвращение к родным. Тем временем, в их родном мире, Альфонс Элрик погружается в изучение алхимии, стремясь найти способ воссоединиться с братом. Он исследует древние тексты и тайные знания, чтобы разгадать загадки, которые могут привести его к Эдварду.
С каждым шагом, который они делают в своих мирах, их судьбы переплетаются, и на горизонте начинает вырисовываться новая угроза. Эдвард и Альфонс сталкиваются с тёмными силами, которые стремятся использовать знания о Шамбале в своих корыстных целях. В этой напряжённой атмосфере братья должны найти путь друг к другу, преодолевая преграды и раскрывая тайны, которые могут изменить их жизни навсегда. Стальной алхимик: Завоеватель Шамбалы — это история о братской любви, поисках истины и борьбе с тёмными силами, которые угрожают их миру.