События аниме "Психопаспорт: Провидение" разворачиваются в январе 2118 года. Главная героиня, Аканэ Цунэмори, занимает пост главного инспектора Бюро общественной безопасности. Она получает тревожные сведения о происшествии на иностранном судне и вместе с Ацуси Синдо, главой отдела статистики Министерства здравоохранения и социального обеспечения, спешит на место событий. Однако, неожиданно полномочия по расследованию передаются Исполнительному отделу, который подчиняется Министерству иностранных дел, что вызывает недоумение у Аканэ.
На борту судна обнаруживают мертвую Доктора Милицию Стронскую, которую Ацуси пригласил в качестве гостя. Расследование указывает на организацию "Нарушителей мира", которая на протяжении длительного времени находилась в поле зрения Исполнительного отдела. Первый отдел департамента уголовного розыска связывается с Департаментом поведенческих расследований для совместной работы над делом. В ходе расследования они встречают Шинью Когами, бывшего беглеца из Бюро, что добавляет интриги в их миссию.
Команда, используя информацию от Дзёдзи Сайги, последнего, кто общался с доктором Стронской, направляется в Дэдзиму, чтобы получить доступ к важному документу, известному как "Документ Стронской". В ходе расследования Аканэ и Когами сталкиваются с масштабной угрозой, связанной с этим документом, что может потрясти основы японского правительства и систему "Сибилла". Это аниме становится связующим звеном между "Психопаспорт: Грешники системы — По ту сторону царства" и "Психо-Пасс 3", раскрывая нерассказанную историю, полную тайн и неожиданных поворотов.
